PrimeMate: Быстрый и оптимизированный генератор праймеров для Ensembl
PrimeMate - это дополнение для Chrome, разработанное PrimeMate, которое служит генератором праймеров для Ensembl. Оно позволяет пользователям генерировать сотни пар праймеров с настраиваемыми параметрами и сортировать их по своим предпочтениям.
С помощью PrimeMate пользователи могут легко работать с геномной базой данных Ensembl, просто переходя к нужной последовательности и нажимая "найти праймеры". Дополнение предлагает ряд настраиваемых опций, таких как оптимальная длина продукта, температура плавления, содержание G/C и порог димеризации/волосатости.
Одной из выдающихся особенностей PrimeMate является его способность отображать подробную информацию для каждого продукта, включая длину, температуру плавления и расположение экзона. Пользователи также могут сортировать сгенерированные результаты на основе своих предпочтений, настраивая вес сортировки для каждой переменной.
PrimeMate идет дополнительную милю, автоматически фильтруя нежелательные продукты, такие как праймеры с самодимеризацией или те, которые имеют неоптимальное расположение на последовательности. Он также предоставляет возможность сохранять выбранные пользователем последовательности в строке "Избранное" для легкого доступа и позволяет без проблем делиться ими, копируя последовательности в буфер обмена.
В целом, PrimeMate - это мощный и эффективный инструмент для генерации праймеров в Ensembl, предлагающий удобный интерфейс и широкий спектр настраиваемых опций.